Το Επιστημονικό Συμβούλιο του Ινστιτούτου (ΕΣΙ) συστήθηκε σύμφωνα με την με αριθμό 03 απόφαση της ΕΑΕ της 21ης/20.11.2024 Συνεδρίασης με θέμα: Σύσταση Επιστημονικών Συμβουλίων των Ινστιτούτων Αγροτικής Έρευνας, της Γενικής Διεύθυνσης Αγροτικής Έρευνας και λειτουργεί σύμφωνα με τις διατάξεις του Νόμου 4310/2014 (ΦΕΚ 258/8.12.2014).
Η σύνθεσή του, σύμφωνα με το με αριθμό 2232/63533/28.11.2024 έγγραφό του ΙΔΕ (Πρακτικό εκλογής Προέδρου του ΕΣ του ΙΔΕ), είναι η ακόλουθη:
1.Δρ Κωνσταντίνος Ιωάννου, Πρόεδρος
2.Δρ Χρήστος Αστάρας, μέλος
3.Δρ Ηλίας Καρμίρης, μέλος
4.Δρ Θεανώ Σαμαρά, μέλος
5.Δρ Δημήτριος Φωτάκης, μέλος
κ. Ευάγγελος Χαβαλές (ΠΕ Δασολογικού), Εκπρόσωπος του μη ερευνητικού προσωπικού του ΙΔΕ
κ. Διονύσιος Γαϊτάνης (ΠΕ Δασολογικού), Γραμματέας